1945年抗战胜利后，张治中被蒋介石调派到新疆处理“伊宁事变”，并于1946年3月出任国民政府西北行营主任，后改为西北军政长官，管辖甘、宁、青、新四省，并兼新疆省主席。在抵达新疆之初，张治中即接受周恩来的建议，应把被盛世才拘捕了多年的中共干部进步人士130多人释放，并派出专车和士兵护送至延安。

为新疆和平解放出力

　　北平和谈因国民党拒绝签字破裂，张治中作为国民党北平和谈代表团团长，和其它团员一起留在了北平，但他的身份还是国民政府西北行政长官。

　　1949年9月8日，毛主席约张治中到菊香书屋，告诉他，中共中央已经决定彭德怀率领第一野战军兵分两路，从兰州和青海向新疆进军。这时，三区参加政协的特邀代表团一行三人已经抵北平，三区与中共是站在一边的，三区民族军与解放军将形成南北夹攻之势，国民党的十万人马已成瓮中之鳖。毛主席说：“我们寄希望于新疆方面能够认清形势，宣布起义。现在，我们从新疆方面得到的消息是，只要你给他们去电，他们就一定会照办。”张治中知道自己的身份出面是合适的，于是神情兴奋地对毛主席说，“我早有此意，只是我在五月份与陶峙岳、包尔汉最后联系后，现在已经与他们失去了联系，现在怎么能够与他们联系上呢？”毛主席笑笑说，“你这个长官，与自己手下失去了联系，我们帮你接上头，我们已经在伊宁建立了电台，由我们的特派员邓力群同志负责那儿的联络工作，你的电报可以通过伊宁转往迪化。”张治中站起来说，“那好，我马上准备电文去。”新疆和平起义，关健人物就是陶峙岳，他是张治中保定军校同期同学，在胡宗南手下工作多年。新疆的十万人马中，除了马步芳一个军的骑兵部队，以及盛世才属下的两个旅外，都是陶峙岳系统的部队，在国民党驻新疆部队中，没有力量能与陶峙岳分庭抗礼。陶岳峙本人一直受国民党蒋介石嫡系所排挤。张治中出任西北军政长官公署长官兼新疆省主席后，将他调入新疆，成为张治中的得力干将，为张治中稳定新疆复杂局面立下了功劳，对张治中自然是心悦诚服，志同道合。因此，张治中出面与他沟通，是再好不过的事了。经过一天的准备，并报请毛主席、周副主席审阅，张治中给陶峙岳和包尔汉的电文于9月10日发出，电文要求他们“正式宣布与广州政府断绝关系，归向人民民主阵营。在中央人民政府未成立之前，接受人民革命军事委员会之领导。”电文发出后，张治中怕他们想不通，又想到许多应该讲清楚的问题，于11日又发出一个给陶峙岳的电文，分析了新疆和平起义的症结和处置办法，就9个方面的内政外联问题作出指示，尽量使和平起义的各种因素都考虑周全。

　　一连几天，不见新疆方面回电，张治中心中有点着急，不知道新疆方面意欲如何？实际上，陶峙岳、包尔汉要处理的是内外多重复杂关系，他们还要保密，直到9月17日，才复电张治中。他们表示，对和平起义之事，正在审慎筹议，前提是保障国家领土的统一完整，维护新疆全省的稳定安定，避免无谓的流血牺牲，在这些工作做好做充分后，将立即宣布与广州政府断绝关系，接受人民革命军事委员会的领导。并希望张治中能来新疆。陶峙岳还专门复了一电给张治中，就张治中提出的9个方面的问题谈了自己的看法，并要求张治中随时给予指示。张治中于9月24日给陶峙岳、包尔汉回了一电，对他们响应中共要求的和平解放新疆宣布起义的积极态度表示充分肯定。并告诉他们，毛主席读了他们的电文感到很高兴，至于自己何时前往新疆，当由中共中央和毛主席来决定，等行期一定，即发电告之。

　　有了张治中的沟通，新疆方面也知道和平起义乃上上策，利国利民利己。于是，9月25日，国民党新疆驻军宣布起义。起义通电由陶峙岳领衔签署，各师旅长连名给毛主席和人民革命军事委员会来电，表示和广州政府断绝关系，接受命令。

张治中被派到新疆协助彭德怀工作

　　1949年11月中旬，中央正式决定派张治中到新疆去工作，做彭德怀的副手，任命他为西北军政委员会副主席，主要做新疆的工作。临行前，毛主席在丰泽园为张治中设宴饯行，陪宴的有周总理等。毛主席风趣地对张治中说，“希望你在西北与彭德怀好好合作，我们再来一次国共合作？”张治中欠欠身子，回答说，“主席，现在是您为首的共产党的领导，谈不上什么国共合作。不过西北人民和部队袍泽怀念我，您认为我有去西北的必要，我一定做好彭老总的顾问。”毛主席听了张治中的话，哈哈一笑，特别点明地说，“你过去是西北四省的军政长官，最高的领导了，现在派你到新疆去，去做彭德怀的副手，委屈了吧？”张治中放下杯箸，站起身来，毕恭毕敬地回答，“我诚意接受，听命令，听吩咐，主席，总理，请您们放心。”

　　宴后，周总理又送张治中回家，在张治中家中与他交谈了三个多小时，并告诉张治中，他此次去西北，政务院已安排好了专机飞抵兰州，周总理将亲自到机场送行。到兰州后，他将立即陪彭德怀一起进疆视察，为新疆工作的全面启动作准备。

　　彭德怀对张治中的到来很重视，迎接也显得非常隆重。在他的率领下，贺龙将军、习仲勋政委和即将宣布成立的西北军政委员会中共方面的全体高级将领停下正在召开的会议，全体出动到兰州机场迎接。稍事休整，与西北军政委员会的同志见面交谈后，张治中就陪彭德怀于当日飞往新疆首府迪化，随行的还有将出任西北军政委员会财经委员会主任贾拓夫。

　　飞机在酒泉降落，他们一行在酒泉过夜，第二天继续飞行，并抵达新疆迪化。彭德怀是豪爽之人，两人交谈不断，话题也主要围绕新疆展开。张治中感叹地对彭德怀说，在新疆，你们湖南老乡真不少。左宗棠收复新疆之后，历任的新疆地方长官搞得都不太好，民族矛盾激化，形成了新疆各族对汉人的较深的敌视。我1946年来新疆时，就表示过，首先要纠正历史错误，偿还历史罪债，并和三区临时革命政府建立了合作关系，采取了一条和平、民主、团结、统一、亲苏的政策，但由于矛盾甚多，积重难返，许多事情没有能够得到很好的处理，但我有一条底线是不可动摇的，那就是对分裂祖国的行动决不手软，坚决采取断然措施。“彭德怀听了这番话，肯定了张治中几年来治理新疆立下的功劳，他说：“新疆问题是很复杂，我们要把矛盾估计得充分一些，你这几年在新疆的工作是很辛苦的，对于我们来说，解决民族矛盾，只有在马克思主义理论的指导下，在无产阶级当权的情况下，才有可能彻底解决这些问题。”   

　　抵达新疆后，彭德怀和张治中立即投入工作，他们与10月下旬率两个军的兵力进驻新疆迪化、已担任中共新疆分局书记的王震碰头，交换看法，同时，与陶峙岳、包尔汉、赛福鼎等开会商讨新疆的整军、整财、整政三大问题。

　　之后，彭德怀主持召集各有关人士研究讨论，并在省政府委员会上通过了《新疆目前施政方针》。这是一份解放初期在新疆进行各项工作的纲领性指导文件。当然，文件中也凝聚了张治中的许多见解。

　　彭德怀和张治中到新疆一个多月后，经过积极的工作，新疆省各项工作都进入了轨道。张治中积极配合彭德怀开展工作，筹备改组省政府、成立新政府和做好新疆起义部队思想教育是当时的两件大事。12月6日，西北军政委员会在新疆召开了驻迪化起义部队机关干部大会。会议由彭德怀主持，陶峙岳将军出席，由张治中作主题报告《怎样改造？》，在这个报告中，张治中强调了中共领导的正确，跟随共产党走是一条光明之路。他介绍了毛主席、周总理对他的关心和帮助，讲了和平解放新疆及中共执政后国内外的有利形势。

　　12月12日，彭德怀主持召开会议，出席会议的人员是中国人民解放军第一兵团部分指战员、新疆起义官兵、机关干部。彭德怀在会上正式宣布起义部队编为中国人民解放军第二十兵团，下辖3个步兵师、两个骑兵师，陶峙岳任司令员，王震兼政治委员。第二天，12月13日，张治中向已经编入中国人民解放军的全体起义官兵作了题为《再谈怎样改造》的报告。彭德怀主持会议，陶峙岳、王震出席。在这个报告中，他主要从参加政协会议谈起，介绍了中共统一战线政策实施的巨大成功。接着，他要求大家对自己的旧意识、旧思想和旧观念来一次彻底的改造，使部队在实质上成为真正的人民解放军。

　　1949年12月17日，新疆省人民政府宣告成立。在成立庆典上，张治中发表了热情的讲话，他相信，在中国共产党的领导下，新疆已经进入了“和平建设的大道，而开辟了远大光明的前途”。